Načelnik upravne enote izvaja s predpisi določene naloge.

Upravna enota opravlja upravne naloge in pristojnosti z delovnih področij: 

• Ministrstva za finance
• Ministrstva za notranje zadeve
• Ministrstva za zunanje zadeve
• Ministrstva za pravosodje
• Ministrstva za obrambo
• Ministrstva za delo, družino in socialne zadeve
• Ministrstva za gospodarstvo
• Ministrstva za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano
• Ministrstva za kulturo
• Ministrstva za okolje in prostor
• Ministrstva za promet
• Ministrstva za šolstvo in šport
• Ministrstva za zdravje
• Ministrstva za visoko šolstvo, znanost in tehnologijo
• Ministrstva za javno upravo

ter druge z zakoni določene upravne naloge.

Zaradi boljše delitve dela in funkcionalne povezanosti z ministrstvi so v upravni enoti organizirane notranje organizacijske enote in službe.

V Upravni enoti Koper sta po delovnih področjih organizirana dva oddelka ter  samostojna služba za skupne zadeve:

• Oddelek za upravno notranje zadeve in delo, vojne invalide, vojne veterane in žrtve vojnega nasilja
• Referat za osebna stanja in migracije
• Referat za javni red in promet
• Izpitni center
• Referat za delo, vojne invalide, vojne veterane in žrtve vojnega nasilja
• Oddelek za okolje in prostor, gospodarstvo in kmetijstvo
• Služba za skupne zadeve
  • Glavna pisarna