Načelnik upravne enote izvaja s predpisi določene naloge.

Upravna enota opravlja upravne naloge in pristojnosti z delovnih področjih: 

• Ministrstvo za finance
• Ministrstvo za notranje zadeve
• Ministrstvo za zunanje zadeve
• Ministrstvo za pravosodje
• Ministrstvo za obrambo
• Ministrstvo za delo, družino in socialne zadeve
• Ministrstvo za gospodarstvo
• Ministrstvo za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano
• Ministrstvo za kulturo
• Ministrstvo za okolje in prostor
• Ministrstvo za promet
• Ministrstvo za šolstvo in šport
• Ministrstvo za zdravje
• Ministrstvo za visoko šolstvo, znanost in tehnologijo
• Ministrstvo za javno upravo

ter druge z zakoni določene upravne naloge. 

Zaradi funkcionalne povezanosti z ministrstvi so na upravni enoti organizirane notranje organizacijske enote in službe.

V Upravni enoti Črnomelj so po delovnih področjih organizirani naslednji oddelki:

• Oddelek za upravne notranje zadeve
• Oddelek za okolje in prostor, gospodarstvo in kmetijstvo
• Oddelek za občo upravo, druge upravne naloge in skupne zadeve

Določene naloge izvajajo:

• Krajevni uradi